Japanska bonsaiverktyg är utformade för specifika arbetsuppgifter. Använd bonsaisaxar för tunna grenar, blad och knoppar; gren- och knoppavbitare för kontrollerat grenarbeten och konkava snitt; rotavbitare för rötter och tjockare material; trådavbitare för bonsaitråd; jin-tänger för barkarbete; och pincetter för mossa, knoppar, ogräs och rötter.
Välj verktyg utifrån det arbete du behöver utföra. Specialverktyg som stamsprä enare och Satsuki-saxar är avsedda för särskilda bonsaitekniker.